1、殺菌劑的選擇根據不同的水質、細菌的種類，特別是pH值。當pH值較高時，不宜用氯氣等氧化性殺菌劑，而季銨鹽類殺菌劑pH值越高越好。當水中含有Fe2＋和H2S時，不宜使用氧化性殺菌劑，否則不僅會增加氧化性殺菌劑用量，而且影響污水處理的水質。與其它水處理劑配伍，不能發生反應相互抵消其效果。具有良好的溶解性，加入后不影響水質加入后，不能增加水中的膠體顆粒數，能均勻溶解水中，且清澈透明。同一污水處理系統應間隔選用不同種類的殺菌劑，以免細菌產生抗藥性 低毒，易降解，無環境污染。
2、殺菌劑的投加
投加方法
連續投加：控制細菌數量的增加
間歇沖擊投加：大劑量投加殺滅 細菌
兩者結合
加藥點:
一般設在污水處理系統的遠端，如進站來水處（除油罐前）。
為確保注水水質，一般在污水處理的濾后或注水泵進口設加藥點。
加藥量
連續式投加：開始濃度較高 ，細菌數量控制下來后，采用相對較低的加藥濃度。有效濃度由室內評價和現場細菌分析確定。
間歇沖擊投加：定期使用較高濃度的
#p#分頁標題#e#殺菌劑通過污水處理系統滅菌。加藥周期、加藥量、加藥時間，根據室內評價和現場細菌分析而定，通過現場實踐進行調整。細菌數量監控水處理系統加入殺菌劑后，要定期取樣，按常規方法進行細菌計數，隨時調整加藥方式和加藥濃度，確保殺菌劑殺菌效果。
